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El laboratorio de proteómica cuenta con los equipos necesarios de electroforesis bidimensional. Estos equipos constan de:

1)      Sistema de Isoelectroenfoque Ettan™ IPGphor™ 3 IEF System, es un sistema para llevar a cabo una primera dimensión electroforética mediante tiras con gradiente de pH inmovilizado (IPG). Tiene una capacidad para 12 tiras de 7,11,13,18 y 24 cm, permite una separación de proteínas según su punto isoélectrico. Incluye un software de control que genera gráficas donde quedan monitorizados los cambios de voltaje, corriente y voltios-hora que van ocurriendo a lo largo del programa de isoelectroenfoque.

2)      Sistema de Electroforesis vertical SDS-PAGE, este sistema permite realiza la segunda dimensión, separando las proteínas según su peso molecular. Consta de varias cubetas de electroforesis, 2 cubetas Ruby 600™ que permiten hacer dos geles a la vez por cubeta y otra cubeta mayor Ettan Dalt Six™ que permite hacer hasta 6 geles a la vez reduciendo así la variabilidad experimental en cada uno de estos geles. Las cubetas  incluyenuna fuente de alimentación EPS 601 Power Suply™ y fuente de refrigeración Multi Temp III Thermostatic Circulator 230 VAC™.

3)      Sistema de Escaneado con el escáner ImageScanner III™, crea imágenes de alta resolución.

Software de análisis de geles de poliacrilamida (geles 2D) ImageMaster Platinum 6™.

La principal aplicación de estos equipos es la caracterización de proteomas de organismos vivos. Esto posibilita observar el perfil proteico de un determinado tejido, en un momento determinado de interés. Esta técnica a su vez permite plantear Proteómica comparativa identificando los spot diferenciales responsables del desencadenamiento de determinadas situaciones de estudio ya sean enfermedades, resistencias a estreses tanto bióticos como abióticos, desarrollo, etc...