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Applied Biosystems Step One Plus Real Time PCR


Year of acquisition:  
Technique:  Reacción en Cadena de la Polimerasa (Termociclador)
Unit:  Forestal y Biodiversidad

Centro de Investigación Agraria La Orden-Valdesequera

Producción Forestal y Pastos

La Orden – Edificio II -Laboratorio 1g10

Responsible
  •  Francisco Vázquez Pardo
  •  0034 924 014 113
  •  francisco.vazquezp@gobex.es
Specifications

Sistema de PCR en tiempo real StepOne Plus de Applied Biosystems que permite el análisis de 96 muestras, pudiendo realizar la detección simultánea de más de un fluoróforo y, por lo tanto, la detección de más de un amplicón en un mismo tubo.

Bloque VeriFlex:25 °C (5 °C zona a zona ). Sistema de ciclo termal: Peltier. Bloque. Formato: Bloque de 96 pocillos. Consumibles compatibles: Placas de 96 pocillos (0.1 mL) con tapas ópticas planas. Placas de 96 pocillos (0.1 mL) con cubierta óptica adhesiva. Tiras de  8 tubos (0.1 mL) con tapas ópticas planas. Tubos individuales (0.1 mL) con tapas ópticas planas. Volúmenes admitidos: 10–30 microlitros

Tasa de rampa: Modo rápido: +/- 2.2 °C/segundos.  Modo estándar: +/- 1.6 °C/segundos. Tasa de rampa del pico del bloque: 4.6 °C/segundo

Rango de temperatura: 4 °C-100 °C. Temperatura. Precisión : +/-0.25 °C (35 °C a 95 °C) de punto de ajuste/visor de temperatura, medida a los 3 minutos de empezar el reloj. Temperatura. Uniformidad: +/-0.50 °C, 30 segundos de empezar el reloj. Resolución de la curva de fusión: 0.1 °C

Sistema óptico: Fuente de excitación azul LED, cuatro filtros de emisión y fotodiodo.

Patrones calibrados en la instalación: FAM, SYBR Green I, VIC®, JOE, NED, TAMRA, patron ROX

Patrones de referencia pasivos: ROX™ o cualquier patrón de calibrado

Recolección de datos: 3 filtros.

Periodo de duración de la cuantificación PCR: Ciclo estándar: Menos de 2 horas. Ciclo rápido: Menos de 40 minutos.

Scope

Este equipo soporta  muchas de las aplicaciones de PCR en tiempo real incluyendo, entre otras: detección de SNPs (Single Nucleotide Polymorphism), estudios de expresión génica, expresión de MicroRNA, expresión de proteínas, análisis de translocación, detección de genes, determinación de carga viral, etc.

El software StepOne™ incluido permite realizar una amplia variedad de métodos de análisis: Curva estándar (cuantificación absoluta), Curva estándar relativa, Comparación Ct (ΔΔCt) (cuantificación relativa), genotipado y presencia/ausencia, Análisis de curva de fusión, Alta resolución de fusión(HRM), etc.

Las diferentes técnicas de PCR a tiempo real permiten la realización de estudios basados en la amplificación de secuencias de ADN de interés. La aplicación de esta tiene utilidad para la determinación y control de fitopatógenos, estudios de filogenia o grado de parentesco entre especies, expresión génica, etc.

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